Das Oberflächenepithel wird infiltriert von zahlreichen dunklen Lymphozyten, welche teilweise von einem schmalen Halo umgeben sind. Das Entzündungsinfiltrat in der Lamina propria ist leicht verdichtet. Unterhalb des Epithels ist ein diskret verdicktes azelluläres Kollagenband erkennbar.
Insgesamt überwiegen in den vorliegenden Biopsien die Merkmale einer lymphozytären Kolitis mit einer Vermehrung intraepithelialer Lymphozyten auf bis zu 90 Lymphozyten auf 100 Epithelzellen (normal bis auf 20 pro 100 Epithelzellen). Herdförmig findet sich in den linksseitigen Kolonbiopsien auch eine grenzwertige Verdickung des subepithelialen Kollagenbandes bis auf 10 Mikrometer Dicke.